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Le programme de recherche Identités et destins cellulaires
(PEPR Cell-ID)

Le Programme de recherche exploratoire Identités et destins cellulaires (PEPR Cell-ID) est financé par France 2030. Son objectif est de déployer la médecine d’interception dans le domaine de la recherche sur les cancers pédiatriques du cerveau. Il dispose d’un budget de 50M€ sur 7 ans.

Actualités

MIPHEI-ViT: Multiplex Immunofluorescence Prediction from H&E Images using ViT Foundation Models

Thomas Walter

14 novembre 2025

Articles scientifiques

A Deep Learning approach for time-consistent cell cyclephase prediction from microscopy data

Thomas Walter // The cell cycle consists of four phases and impacts most cellular processes. In imaging assays, the cycle phase can be identified using dedicated cell-cycle markers. However, such markers occupy fluorescent channels that may be needed for other reporters. Here, we propose to address this limitation by inferring the phase from a widely used fluorescent reporter: SiR-DNA.

14 novembre 2025

Articles scientifiques

STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport

Laura Cantini // In dynamic biological processes such as development, spatial transcriptomics is revolutionizing the study of the mechanisms underlying spatial organization within tissues. Inferring cell fate trajectories from spatial transcriptomics profiled at several time points has thus emerged as a critical goal, requiring novel computational methods.

14 novembre 2025

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CELL CONTEXT | Accès à l’identité des cellules individuelles dans leur contexte spatial originaire

Analyse des changements génomiques dans chaque cellule d’un tissu lors de la différentiation.

CELL EXP | Systèmes expérimentaux spécialisés

Étude des interactions cellulaires via des organoïdes cérébraux et de la visualisation de données, pour simuler les mutations à l’origine des tumeurs cancéreuses.

DATA MED | Traitement des données vers l’interception des maladies

Modèles prédictifs de trajectoires cellulaires basés sur des données biologiques massives, pour anticiper et comprendre les déviations neuronales.

CELL NEXT | Formation et développement de carrière & Innovation

Programme sur-mesure de formation et carrière, alliant enseignement et recherche en innovation moléculaire, cellulaire et épigénétique appliquées aux cancers.

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