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Le programme de recherche Identités et destins cellulaires
(PEPR Cell-ID)
Le Programme de recherche exploratoire Identités et destins cellulaires (PEPR Cell-ID) est financé par France 2030. Son objectif est de déployer la médecine d’interception dans le domaine de la recherche sur les cancers pédiatriques du cerveau. Il dispose d’un budget de 50M€ sur 7 ans.
scConfluence: single-cell diagonal integration with regularized Inverse Optimal Transport on weakly connected features | Nature Communications
The abundance of unpaired multimodal single-cell data has motivated a growing body of research into the development of diagonal integration methods. However, the state-of-the-art suffers from the loss of biological information due to feature conversion and struggles with modality-specific populations…
5 septembre 2024
A point cloud segmentation framework for image-based spatial transcriptomics | Nature
Recent progress in image-based spatial RNA profiling enables to spatially resolve tens to hundreds of distinct RNA species with high spatial resolution. It presents new avenues for comprehending tissue organization. In this context, the ability to assign detected RNA transcripts to individual cells is crucial for downstream analyses, such as in-situ cell type calling…
6 juillet 2024
Multiplexed chromatin imaging reveals predominantly pairwise long-range coordination between Drosophila Polycomb genes | Cell Reports
Polycomb (Pc) group proteins are transcriptional regulators with key roles in development, cell identity, and differentiation. Pc-bound chromatin regions form repressive domains that interact in 3D to assemble repressive nuclear compartments. Here, we use multiplexed chromatin imaging to investigate whether Pc compartments involve the clustering of multiple Pc domains during Drosophila development….
25 mai 2024
Pas d’actualités
CELL CONTEXT | Accès à l’identité des cellules individuelles dans leur contexte spatial originaire
Analyse des changements génomiques dans chaque cellule d’un tissu lors de la différentiation.
CELL EXP | Systèmes expérimentaux spécialisés
Étude des interactions cellulaires via des organoïdes cérébraux et de la visualisation de données, pour simuler les mutations à l’origine des tumeurs cancéreuses.
DATA MED | Traitement des données vers l’interception des maladies
Modèles prédictifs de trajectoires cellulaires basés sur des données biologiques massives, pour anticiper et comprendre les déviations neuronales.
CELL NEXT | Formation et développement de carrière & Innovation
Programme sur-mesure de formation et carrière, alliant enseignement et recherche en innovation moléculaire, cellulaire et épigénétique appliquées aux cancers.
Pas d’actualités
L’équipe Cell-ID
Directrice scientifique : Geneviève Almouzni
La coordination
Directrice scientifique : Geneviève Almouzni
Responsables scientifiques des projets ciblés :
- Cell Context : Giacomo Cavalli et Marcelo Nollmann
- Cell Exp : Gaëlle Legube et Stéphane Nedelec
- Data Med :
- Data : Daniel Jost et Thomas Walter
- Med : Laure Bally-Cuif et David Castel
- Cell Next : Geneviève Almouzni, Sophie Jarriault et Thomas Walter
Managers scientifiques :
- Coodination : Therese Wilhelm
- Data Med : David Sitbon
- Cell Next : Susana Abreu Ribeiro
Chief Data Officer : Amna Chabaane
Chargées de communication : Marie Origas (CNRS) et Ana Garre Debiès (Inserm)
Cell Context | Accès à l’identité des cellules individuelles dans leur contexte spatial originaire
Giacomo Cavalli et Marcelo Nollmann, responsables scientifiques du projet ciblé
Data Med | Traitement des données vers l’interception des maladies
Thomas Walter et Daniel Jost, responsable scientifiques du projet ciblé Data
Data
- Emmanuel Barillot / Laurence Calzone
- Laura Cantini
- Philippe Hupé
- Sophie Jarriault
- Daniel Jost
- Vera Pancaldi
- Nicolas Servant
- Thomas Walter
Laure Bally-Cuif et David Castel,
responsables scientifiques du projet ciblé Med
Med
Cell Exp | Systèmes expérimentaux spécialisés
Gaëlle Legube et Stéphane Nedelec, responsables scientifiques du projet ciblé
Cell Next | Formation et développement de carrière & Innovation
Quelques chiffres
30
grands défis
lancés
60
chercheurs
permanents
20
doctorants
40
post-doc



